發(fā)布時(shí)間：2022-08-15 瀏覽次數(shù)：10696
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科研技術(shù)服務(wù)平臺(tái)多樣 滿足不同樣本實(shí)驗(yàn)需求
▲伯豪生物（部分）技術(shù)平臺(tái)展示
空間轉(zhuǎn)錄組是從空間層面上解析 RNA-seq 數(shù)據(jù)的技術(shù)，通過對(duì)組織切片、測序獲得組織空間中的 mRNA 表達(dá)信息、 定位和區(qū)分功能基因在特定組織區(qū)域內(nèi)的活躍表達(dá) 。
| 序號(hào) | 技術(shù)服務(wù) | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 樣本 |
| 1 | FFPE 空間轉(zhuǎn)錄組測序 [科研服務(wù)] | ★腫瘤學(xué)；★免疫學(xué)；★生長發(fā)育；★神經(jīng)科學(xué)；★病理學(xué) ； ★多組學(xué)聯(lián)合（例如：單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 + 空間轉(zhuǎn)錄組等） | FFPE （臨床樣本） |
| 2 | 空間轉(zhuǎn)錄組測序 [科研服務(wù)] | ★腫瘤學(xué)；★免疫學(xué)；★生長發(fā)育；★神經(jīng)科學(xué)；★病理學(xué) ； ★多組學(xué)聯(lián)合（例如：單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 + 空間轉(zhuǎn)錄組等） | 新鮮冰凍組織 |
| 3 | Visium HD | 空間基因表達(dá) [科研服務(wù)] | ★腫瘤研究；★免疫研究；★生長發(fā)育；★神經(jīng)科學(xué)。★多組學(xué)聯(lián)合。 | FFPE (人 / 小鼠） |
| 4 | 亞細(xì)胞空間 |Xenium 原位分析 [科研服務(wù)] | ★腫瘤研究；★免疫研究；★生長發(fā)育；★神經(jīng)科學(xué)；★病例診斷； ★新藥研發(fā)。 ★多組學(xué)聯(lián)合。 | 人 / 小鼠 定制 panel |
| 普通轉(zhuǎn)錄組 VS 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 VS 空間轉(zhuǎn)錄組 | ||
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普通轉(zhuǎn)錄組 得到組織中混合細(xì)胞（bulk）表達(dá)情況，無法解析細(xì)胞表達(dá)異質(zhì)性，即無法得到每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)情況。 | 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組 10x genomics 等單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)可以得到每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)情況，從而解析組織內(nèi)細(xì)胞異質(zhì)性。 | 空間轉(zhuǎn)錄組 10x visium 等將組織切片與轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)合，實(shí)現(xiàn)空間信息和轉(zhuǎn)錄本信息的獲取。添加基因表達(dá)空間分布信息，進(jìn)一步提高組織內(nèi)部分辨率。 |
| 序號(hào) | 協(xié)助客戶發(fā)表文章 | 雜志 | IF | 日期 | 樣本類型 |
| 1 | Abnormal metabolism in melanocytes participates in the activation of dendritic cell in halo nevus | CLINICAL IMMUNOLOGY | 8.6 | 2024 | 暈痣 |
| 2 | Single-cell and spatial heterogeneity landscapes of mature epicardial cells | Journal of Pharmaceutical Analysis | 8.8 | 2023 | 心臟 |
| 3 | High-resolution anatomical and spatial transcriptome analyses reveal two types of meristematic cell pools within the secondary vascular tissue of poplar stem |
MOLECULAR PLANT | 21.949 | 2023 | 楊樹莖 |
| 4 | Clinical challenges of tissue preparation for spatial transcriptome |
Clinical and Translational Medicine | 8.554 | 2022 | 組織 |
| 5 | Single-cell and spatial analysis reveal interaction of FAP+ fibroblasts and SPP1+ macrophages in colorectal cancer |
Nature Communications | 17.694 | 2022 | 組織 |
